芝加哥大学分子工程研究所，成立于2011，是美国阿贡国家实验室的合作伙伴关系，是一个变革的学术单位，探讨了科学与工程的交叉，解决具有全球意义的技术问题，并不断激励应用分子水平的科学创新。该学院提供分子工程学学士学位课程。
芝加哥大学分子工程本科专业研究领域
主修项目都为本科生提供各种各样的以技术为重点的行业的就业机会，并为毕业生在科学、工程、医学、商业或法律等领域深造深造。该研究所旨在引入发明和设计，以及探究和发现，作为富有成果和互补的智力活动。专业可以从三个定量工程分析轨道中选择：
以工程为导向，以化学和软材料为重点
专注于生物学的轨道
面向应用物理学的轨道，与物理系密切合作提供
分子工程学辅修项目是专为物理或生物科学、数学、计算机科学、经济学或相关领域的本科生设计的。该项目的总体目标是向学生提供基本的工程工具和思维方法，以增强科学方法和解决问题的能力。
芝加哥大学分子工程本科专业常见课程
新兴技术导论
材料科学与工程导论
水分子科学与工程
计算材料科学
分子工程动力学
实验技术与先进仪器
固态纳米电子器件的物理学
量子计算
分子工程专题：分子/材料模拟
分子工程学专题：组织修复的工程与生物学
细胞工程
微流控芯片技术及其应用
定量系统生物学
保护工程原理
工程电动力学
工程分析导论
热力学与统计力学
生物材料
哈佛大学
纽约大学
布朗大学
杜克大学
约翰霍普金斯大学
加州大学伯克利分校
哥伦比亚大学
达特茅斯学院
美国石溪中学